Outre les activités traditionnelles telles la pêche et l'exploitation des algues, la prise en compte des activités liées au tourisme sont cruciales pour le développement économique de la mer d'Iroise, mais également pour le respect des milieux naturels qu'ils soient terrestres (îles, îlots...) ou maritimes (fonds marins).

Le mer d'Iroise est en effet un véritable repère pour de nombreuses colonies de phoques et de dauphins, et plus globalement pour les mammifères marins (1/4 de la population des côtes de France est concentrée en mer d'Iroise).

Les 300 espèces d'algues qui y sont présentes en font le plus grand champ d'algues en Europe et la quasi-totalité des espèces de poissons de la façade Atlantique française et de la Manche y est représentée.

Les missions du Parc naturel marin d'Iroise visent notamment à articuler au mieux les activités humaines et la préservation de la diversité et la richesse de la flore et de la faune de cet espace maritime exceptionnel.